解決できなかった疑問に対して、詳しい方からご回答頂けて非常に助かりました。
重ねてお礼申し上げます。

どうもずっと、ケアルラさんは手段が目的になっているような気がします。
少なくとも、当サイトで書いているSMART情報を確認する目的は、
動作に異常があるハードディスクの原因を調べるためです。
現状パソコンを使えているのに、そこまで固執する必要はありません。

また、SMART情報に異常値があれば、そのハードディスクがダメなわけでもありません。
SMARTの各属性とその値は、規格で統一されているわけでもなく、
メーカーによって、ファームウェアによって扱いが異なるからです。
ただ、これを不良セクタの把握に使えることがある、という程度です。
もともとが、セルフモニタリングのための機能なので。

データの重要度が高いのであれば、バックアップとミラーリングを併用してください。

理解したつもりになってもまたわからないことがでてくる、本当にコンピューターは複雑です。

急なクラッシュもありえると見てバックアップを取りつつ、SMART情報（主に05、C4、C5、C6の生の値）に悪化がないか見て、たまにchkdsk rをかけて使おうと思います。

このSMART情報の信用度が低いとのことですが、それは別の値が表示されていたり、HDD状態の悪化がSMART情報に反映されないこともありえるということなんでしょうか。
そうだとすれば、上記のことを行っていても、このHDD状態の変化を把握することは難しいんですねえ…
上記のことを行っていればだいたいOK、なのでしょうか。

SMART情報がどのように扱われるかは、ハードディスクのファームウェア次第です。
当該ハードディスクの不良セクタに関する属性値は、
不良セクタの実際の数を表したものではないと考えたほうがよさそうです。

ファイルシステムに関しては、特に問題はないと思います。
これはたとえば、不良セクタが登録されているけど、実際には存在しない、
「chkdsk /b」が実行される前のドライブと似ています。
必要のない情報がファイルシステムに保存されているだけで、
それが害を及ぼすわけではありません。

ちょうど先の回答に関連しますが、
これはWindowsのファイルシステムに関するバグなんじゃないかと思います。
従って、アップデート後にはこのようなゴミデータが残されなくなり、
同様のログは出力されなくなったのではないかと。
あくまでも推測ですけどね。

そのハードディスクに関しては、実際に使っていて問題がなさそうなら、継続使用してもいいんじゃないでしょうか。
ただし、得られる情報は信用できないものが多く、大丈夫とも言い切れないので、
心配なら、本当に重要なデータだけ、外付けハードディスクに保存しておくとか。

あとひとつchkdskについて不明なことがありまして…

大手中古PCショップで購入したPCですが、購入当初から添付画像の状態です。
代替処理済みセクタが増え続けたりしなければ、HDDの状態に注意しながら１年くらい使おうと思っております。

このPCにchkdskをかけると、不良セクタはありませんが
Cleaning up *** unused index entries from index $SII of file 0x9.
Cleaning up *** unused index entries from index $SDH of file 0x9.
Cleaning up *** unused security descriptors.
とログに出ます。
（***には数字が入ります）
（windows10大型アップデートするとchkdskのログが全て消え、新たにchkdskを行ってもログが出力されなくなったので、上記したのは正確なログではありませんが）

chkdsk fを数回かけて***の数値を１ケタにしても、一ヶ月後にchkdsk fをかけると***の数値が100近く増えています。

これはファイルシステムのエラーだと言う人もいれば、
ファイルシステムに問題はないので無視して構わない、
と言う人もいてよくわかりません。

この数値の数だけファイルシステムにエラーが起きた、
このエラーがデーター領域で起こればデーターが壊れる、
つまりこのHDDはデーターが壊れやすいということでしょうか？

Windowsのシステムファイルに関しては、「sfc /scannow」を実行すれば、
その時点のWindowsが判断する正しいシステムファイルに置き換えられるでしょう。

ただし、記憶装置に対するデータの入出力に異常がない前提です。
従って、SMART情報とchkdskに異常がなければ、ほとんどの場合は大丈夫だと思います。

例外は、ソフトウェアに起因する不具合です。
アップデータに問題があれば、データを正常に更新できたとしても、システムとして機能しなくなるかもしれません。
実際に、「Windows Update」後に問題が発生するケースもしばしばあると思います。
アプリケーションソフトウェアのバグで、保存したファイルが壊れてしまうこともあります。
また、不正なプログラムが実行されれば、何がどう書き換えられるかわかりません。

もっと言えば、不良セクタに関しても注意が必要で、
SMART等に現れるのは事後の情報なので、保存した時点ではデータの完全性は不明です。
シュレーディンガーの猫みたいな。
でもこれは重箱の隅をつつくような話なので、状態の悪いハードディスクでもない限り大丈夫ですけど。
ただ、可能性はゼロではないということです。

そもそも、何をもって完全なのかという話で。
メーカーが設定する完全なデータよりも、システムやアプリケーションを使えることのほうが重要な場合もあります。
多少システムの整合性に問題があったとしても。

神経質に突き詰めても、きりがありません。
世の中の物理現象も、完全に解明しているわけではありませんからね。
その上で作られている工業製品は、言わずもがなです。

やはりそうなのですね…
データーに完璧は求められない、と。

OSやアプリやファイルにわかりやすいエラーも出ず
アプリケーションも変わらず動作している
テキストファイル、画像ファイル、一見問題なさそう
動画ファイル、音楽ファイル、問題なく思える
PSDファイル問題なく思える
こんな感じで問題がなさそうな上に

S.M.A.R.T.情報問題なし。
chkdsk /r
DISM.exe
sfc/scannow
これらのコマンドでも問題が見つからない。

こんな万全の状態だとしても、OSやアプリケーションやファイルが壊れていることはある。
という認識で合ってますでしょうか。

重ね重ね申し訳ございません。

こんな感じで問題なさそうなのに、OSやアプリケーションやファイルが壊れていることはありますか。

あります。
不具合が顕在化するまでは問題が発覚しないだけで、一部のファイルが壊れていることはあります。
たとえば、普段使っていない機能に関するファイルが壊れていたとしても、その機能を使うまでは気がつかないでしょう。

特に不良セクタはその傾向が強く、お客さんが不具合に気づいてパソコンを持ってきた時には、
すでに状況がかなり悪化している場合が多いです。
これも、お客さんが必要なファイルにアクセスできなくなったり、Windowsのエラーが発生して操作できなくなったりするまでに、
データを読めないセクタが潜在的に増え続けてきた結果です。
実際に不具合が発生するまでは、ほとんどの人は不良セクタの存在に気がつかないと思います。

ありません。
結局、データに欠損がなくても、ソフトウェアにバグはつきものなので、
動いていればそれでいいと割り切る必要はあると思います。
完璧なものは世の中に存在しませんからね。

はじめまして。どうにも悩んでいることがありまして、書き込みさせていただきます。
長く使っていたPCが壊れて以来、データーの完全性について悩んでおります。
わかりやすくエラーが出たりわかりやすくファイルが壊れるのではなく、気付かないうちにデーターが壊れてしまっていたら…という心配です。

HDDやSSDが動作中や停止中等に、エラーや電遮断や衝撃等があったり、振動が続く環境で使用していたり。
HDDやSSDに論理障害があったり。

色んな原因で、OSやアプリケーションやファイルが壊れてしまうことがあると思います。

OSやアプリやファイルにわかりやすいエラーも出ず
アプリケーションも変わらず動作している
テキストファイル、画像ファイル、一見問題なさそう
動画ファイル、音楽ファイル、問題なく思える
PSDファイル問題なく思える

こんな感じで問題なさそうなのに、OSやアプリケーションやファイルが壊れていることはありますか。
もしあるなら、OSやアプリケーションやファイルが壊れていないか確認する方法（ハッシュ値の比較以外で）はありますか？

お答え頂けるとうれしいです。