MBRディスクとGPTディスクの違い

互換性

MBRディスクとGPTディスクに、互換性はありません。
GPTは比較的新しい仕組みのため、
古いシステムはGPTディスクに対応していません。※「Windows XP」以前とか。

また、シンプルなシステムは、MBRディスクで運用されています。
GPTを使うメリットがないからです。
管理領域のデータサイズは、MBRディスクのほうがずっと小さいです。
USBメモリやSDカード等、汎用性が高く、容量もそれほど大きくない記憶装置は、
基本的にMBRディスクで使われています。
プリンタ等、拡張性のないデバイスも、MBRディスクにしか対応していないことがあります。

利用可能なデータサイズの上限

MBRのパーティションテーブルのデータサイズは、非常に小さいです。
LBAに割り当てられているのは、わずか4バイトです。
このため、論理セクタサイズが512バイトの記憶装置では、
512×256⁴ ＝ 2TiBまでの領域しか管理できません。

一方、GPTはデータサイズに余裕があり、LBAは8バイトなので、
512×256⁸ ≒ 8.6×10⁹TiB（8ZiB）と、実用上は上限を気にせずに使えます。

これらの理由から、

で使われることが多いです。

ただし、2TB以下の記憶装置でも、GPTディスクで運用することは可能です。
UEFIブートに対応するシステムディスクでは、このケースを目にします。
逆に、3TB以上のハードディスクをMBRディスクで使うこともできますが、
扱えるのは2TiBまでの領域だけです。

誤解しないでほしいんですが、大は小を兼ねません。
大容量に対応しているからと、何でもGPTディスクにすればいいわけではありません。
先の互換性でも述べたとおり、MBRディスクにしか対応していないデバイスは多いからです。
新しければ大丈夫なわけでもありません。
最適なディスク形式で使うことが重要です。

作成できるパーティションの数

前項の理由と同様に、MBRのパーティションテーブルのデータサイズには限りがあるため、
パーティションを4つまでしか作れないという制約があります。
ただし、ここでのパーティションは、プライマリパーティションと拡張パーティションを指します。
つまり、MBRのパーティションテーブルで管理できるパーティションの数が4つまでなのです。
論理ドライブを使えば、MBRディスクでも5つ以上のパーティションを作成することは可能です。

一方、GPTディスクでは、GPTでパーティションを管理しているため、
通常の操作で5つ以上のパーティションを作成できます。※最大128。

UEFIブートへの対応

UEFIによる起動に対応するためには、GPTディスクでなければなりません。
システムディスクが2TB以下でもGPTなのは、UEFIブートに対応するためです。

Windowsが広くUEFIブートに対応し始めたのは「Windows 8」からなので、

である可能性が高いです。
特に、プリインストールされているWindowsは、この傾向があります。

ただし、32/64bit版の違いや、
「Windows 8」以降でもMBRディスクを使い続けることは可能なので、
Windowsのバージョンで区別するのは、ちょっと乱暴かもしれません。
要は、UEFIブートに対応するために、システムディスクはGPTになったということです。

MBRディスクとGPTディスクの変換

MBRディスクとGPTディスクは、まったく違う仕組みでパーティションを管理しています。
これは、ドライブを作成する以前の問題で、
パーティションの前提が違うことを意味します。

従って、MBRディスクかGPTディスクかを決めるのは、パーティションを作成する前の段階です。

新品のハードディスクであれば、「ディスクの初期化」の際。

使用中のハードディスクであれば、パーティションをすべて削除した後に、
MBRディスクは「GPTディスクに変換」できます。

同様に、GPTディスクは「MBRディスクに変換」できます。

使用中のハードディスクを、後で変換することはできません。
パーティションを、一旦すべて削除する必要があります。

データを維持したまま、MBR/GPTディスクを変換できるツールもありますが、
イレギュラーな処理になります。
本来なら、パーティションの開始位置が変わるので、
大規模なデータの移動が必要になるはずだからです。
少なくとも、システムディスクに適用するのは避けたほうがいいと思います。（MBR2GPTとか）